6D Mark II和6D在外观造型上以及按键布局上变化不大，不过在手柄的线条上做了优化调整，使得握持更稳定也更舒适，所以在宽高几乎一致的情况下，略厚了3.6毫米，整体重量也略重了约10克。（尺寸约144.0×110.5×74.8毫米[宽×高×厚]，仅机身约685克、含电池存储卡约765克）
机身正面
机身背面
两侧依然是卡槽仓和端子仓，包括单SD卡槽和N3型遥控、外接麦克风输入、数码、HDMI mini输出4种端子，只是布局稍微改变了一下，6D Mark II将N3型遥控端子从侧面改到了相机正面端子侧的下方。
机身左侧
机身右侧
顶部按键布局、肩屏、热靴等也基本没变化，在快门键边上增加了自动对焦区域选择模式按钮（由于对焦的大幅增强，6D Mark II使用中点对焦以外的场合也大大增加），方便切换；另外，模式拨盘也增加了一般更专业机型才会有的模式转盘解锁按钮，避免了拍摄模式的误触改变。
机顶
机底
此次6D Mark II在外形上的最大改变还是来自液晶屏，从传统的固定式液晶屏改为了翻转屏，而这块翻转屏是佳能一贯的旁轴翻转屏，相比上下结构的翻折屏有更多的取景便利，尤其是竖构图时依然可以高低角度取景，几乎就是全视角覆盖。
新增自动对焦区域选择模式按钮
模式拨盘增加模式转盘解锁按钮
另外，这块翻转屏也支持触摸操控，对于想一步到位的新玩家，可以触摸操作对于全画幅这样的专业单反来说，上手难度降低了很多。
LP-E6N电池、容量1865mAh
EF 24-105mm f/4L IS II USM套机镜头
其他方面主要是一些细枝末节上的优化，比如多功能锁开关从滑动开关式改成了拨杆式。
